Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED4Q96RK1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED4Q96RK1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms