Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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