Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNT1Q96Q11 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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