Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LMTK3Q96Q04 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMTK3Q96Q04 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms