Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms