Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms