Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.9 ms