Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP57Q96MR6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP57Q96MR6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms