Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT74Q96LB3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT74Q96LB3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms