Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHACTR3Q96KR7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms