Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABS1Q96KC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms