Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A2Q96JW4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms