Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAMP1Q96JM3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms