Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF6Q96J87 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF6Q96J87 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms