Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED3Q96IU2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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