Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VSIG2Q96IQ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms