Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM3Q96HU1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.5 ms