Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf44Q96CB5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf44Q96CB5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms