Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms