Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms