Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR2Q969E8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms