Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA6Q92908 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms