Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms