Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4AQ8WYN0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms