Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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