Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms