Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP2Q8WWK9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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