Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTSF1Q8WW33 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms