Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRUNE2Q8WUY3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms