Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC12Q8WUD4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms