Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX29Q8TEQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms