Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK1Q8TDC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms