Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK9Q8TD19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
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