Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms