Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms