Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms