Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms