Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCPH1Q8NEM0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCPH1Q8NEM0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms