Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPC24Q8NBT2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms