Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH13Q8NBN7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms