Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZIC4Q8N9L1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms