Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA1Q8N8W4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms