Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAP2Q8IXW5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms