Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms