Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8AQ8IWT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8AQ8IWT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8AQ8IWT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms