Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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