Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DZIP3Q86Y13 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms