Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms