Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMC4Q7Z404 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC4Q7Z404 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms