Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms